Отец родился в семье знаменитого партийного деятеля Тувинской АССР, редактора газеты Кужугета Шойгу и зоотехника Александры Яковлевны Кудрявцевой, которая была родом из Луганской области. Мать Ирина, урожденная Антипина, была дочерью начальника строительной организации Красноярска. Во время студенчества у Сергея и Ирины завязались теплые отношения, которые переросли в крепкий брак. Из Красноярска сразу после окончания вуза молодая семья перебралась в Кызыл, где Сергей начал работать по специальности. Но через год после рождения дочери, в связи назначением главы семейства на должность прораба крупной строительной организации, они переезжают в Ачинск, потом в Саяногорск, а затем в Абакан.

Параллельно с основной деятельностью Сергей Кужугетович занял пост второго секретаря областного отделения партии, но почти сразу в 1990 году его перевели в Москву. Из-за частых переездов семьи Юля в детские годы постоянно меняла место учебы. Но заканчивала она десятилетку уже в Москве. После чего девушка поступила на психологический факультет МГУ. Такая тяга к изучению душевного здоровья человека для нее оказалась закономерной. Известно, что две ее родных тети по отцу, Лариса и Ирина, посвятили свою жизнь работе психиатрами.

Значительно позже своего окончания университета, в 2003 году, Юлия защитила кандидатскую диссертацию по теме, которая раскрывает проблемы отбора курсантов в ряды МЧС. Свою работу Юлия Сергеевна писала не голословно, опираясь только на чужой опыт. К этому времени она сама уже прошла путь от работы психологом службы помощи МЧС до ее руководителя.