Его жизнь трагически оборвалась 8 лет назад. Тело артиста со следами насильственной смерти нашли в его квартире. Поначалу говорилось, что Панин умер в результате несчастного случая, упав с высоты собственного роста и ударившись головой. Однако судмедэксперты пришли к выводу, что в результате случайного падения актер не мог получить такие повреждения: лицо Панина было разбито в кровь, правый глаз закрылся от выраженной параорбитальной гематомы, обнаружены ссадины на костяшках пальцев рук, гематомы в области коленных суставов, в ранах были найдены осколки стекла. Панин, скорее всего, сопротивлялся и ранил убийцу. На борьбу указывали и другие признаки: следы крови, беспорядок по всей квартире, сдвинутая мебель.

СК РФ возбудил уголовное дело о причинении тяжкого вреда здоровью, повлекшем по неосторожности смерть потерпевшего. В 2015 году стало известно, что уголовное дело закрыли «за отсутствием состава преступления». По мнению Геннадия Русина, Андрей Панин был убит, однако произошло это не намеренно. «Я думаю, конечно, убивать его никто не собирался. Он же боксом занимался и вступил в поединок с теми людьми. В результате они ушли и закрыли с обратной стороны дверь на ключ. А в этот момент мой друг лежал и истекал кровью. Андрей умер из-за отека мозга», - сказал он.

Русин сообщил, что друзья Панина организовали собственное расследование, которое привело их к украинским бизнесменам, которые «взяли в оборот» и обманули Панина, когда тот снимался в Крыму. «Видимо, эти люди приехали в Москву, чтобы его припугнуть. Это уже наше внутреннее расследование. Это было уже после того, как закрыли дело. С Украиной тогда были уже натянутые отношения, хоть и Майдана еще не было. Мы пришли к этой версии, и она подтверждалась, но мы решили, что Господь Бог накажет этих людей», - рассказал друг артиста.