Детали его первого брака остаются за кадром истории. Сегодня министр живет в браке во второй раз. Его нынешняя супруга, Лариса, также имеет экономическое образование. Лариса Белоусова (девичья фамилия Авдеева), родившаяся 3 октября 1961 года, занимает должность руководителя управления конференций в информационном агентстве ТАСС с 2016 года. Совместных детей у супругов нет.

Несмотря на отсутствие общих детей с нынешней супругой, у Андрея Белоусова есть сын от первого брака — Павел, родившийся 24 мая 1994 года. Павел выбрал путь бизнесмена, что свидетельствует о том, что предпринимательские способности передаются по наследству.

Согласно информации, опубликованной на forbes.ru, годовой доход семьи Белоусовых составляет 93,3 млн рублей. При этом доход самой Ларисы Белоусовой достигает 61,6 млн рублей, что делает её одной из самых успешных женщин в экономической сфере России.