В 2013 году журналистка вышла замуж за коллегу Евгения Попова — ныне депутата Госдумы от партии «Единая Россия» и заместителя председателя думского комитета по информационной политике, информационным технологиям и связи.

Будущие супруги познакомились на работе: Попов был корреспондентом канала «Россия 1» в Нью-Йорке, в то время как Скабеева снимала репортажи для телеканала в Москве. Они поженились в Нью-Йорке.

«Мы настолько разные, что нам невозможно было не соединиться. Невозможно было абсолютно. (...) Мы двое как плюс и минус, потому что я люблю поспать, Ольга любит встать в шесть. Я люблю быть за стенами дома, гулять. Ольга любит, наоборот, дома побыть. Нам надо было встретиться, надо было друг друга полюбить», — рассказал Попов.